Só vai funcionar com um número, porque não há possibilidade de instalar dois aplicativos do whatsapp no mesmo celular, entendeu?
O problema não são as linhas mas sim porque tem apenas um aplicativo instalado, devido ao sistema de login, que não dá possibilidade de trocar o logo.
Olha pra contrariar esse pessoal que não estão bem informados há como usar 2 whatsapp em um celular dual chip eu tenho um s5 duos e uso 2 whatsapp nele dúvida meu whatsapp é 14998948013.
Voce pode ter mais de um cadastro no whatsapp porem em telefones diferentes e números diferentes, o aplicativo não permite utilizar dois numeros em um mesmo celula